Dictionnaires
Un dictionnaire est une structure de données qui contient une collection non ordonnée (pas d'indice) de couples clé/valeur (pouvant être de types différents)
Dictionnaires#
Déclarer un dictionnaire
dico = {cle1: valeur1, cle2: valeur2, …}
dico_vide = {}
On accède aux valeurs d'un dictionnaire par ses clés
dico[cle]
Liste des clés d'un dictionnaire : dico.keys()
Liste des valeurs d'un dictionnaire : dico.values()
Liste des couples clé/valeur d'un dictionnaire : dico.items()
Note
Les liste retourné se comportent presque comme des listes mais n'en sont pas tout à fait. On peut obtenir une vraie liste en faisant : list(dico.keys())
for cle, valeur in dico.items():
print(f"La clé {cle} contient {valeur}")
Longueur (nb. de couples) d'un dictionnaire
len(dico)
Note
len fonctionne sur beaucoup de types qui ont une longueur : str, list, tuple, dict, set, range…
Tester l'existence d'une clé
if cle in dico #retourne True si la clé existe
Modifier une valeur ou Ajouter un couple (selon si la clé existe ou pas)
dico[cle] = valeur
Supprimer un couple
del dico[cle]
Vider un dictionnaire
dico.clear()
Pratique 7#
Exercice A#
Créer un programme python exo7_a.py qui créer un dictionnaire associant à chaque base de l'ADN la chaine "purinique" (C et G) ou "pyrimidinique" (A et T) selon la base : puis qui demande à l'utilisateur (fonction input()) d'entrer une base, et enfin qui affiche si la base entrée par l'utilisateur est purinique ou pyrimidique.
Exercice B#
En utilisant un dictionnaire et la fonction in (clef in dictionnaire), créer un programme python exo7_b.py qui stocke dans un dictionnaire le nombre d’occurrences de chaque acide aminé de la séquence AGWPSGGASAGLAILWGASAIMPGALW, puis afficher ce dictionnaire.
Votre programme doit afficher :
{'P': 2, 'I': 2, 'W': 3, 'G': 6, 'L': 3, 'A': 7, 'M': 1, 'S': 3}
Exercice C#
Voila un dictionnaire faisant correspondre à chaque espèce la longueur de son génome :
dico_espece = {'Escherichia coli':3.6,'Homo sapiens':3200,'Saccharomyces cerevisae':12,'Arabidopsis thaliana':125}
Créer un programme python exo7_c.py dans lequel vous créez ce dictionnaire et qui permet d'afficher le nom de l'organisme possédant le plus grand génome.
Exercice D#
Le fichier sequences_especes.tsv est un fichier tabulé (2 colonnes séparées par des tabulations) contenant un identifiant de séquence dans la première colonne, et l’espèce associée dans la secondes colonne.
Homo sapiens 27292
Saccharomyces cerevisiae S288C 850883
Homo sapiens 55226
Mus musculus 19791
Créez un script exo7_d.py qui lit ce fichier et, à l’aide d’un dictionnaire, écrit un fichier de sortie qui contient le nom d’une espèce précédé d’un dièze sur une ligne puis tous les identifiants de séquence associés à cette espèce sur les lignes suivantes.
# Homo sapiens
27292
55226
....
# Saccharomyces cerevisiae S288C
850883
....