Pratique 4

• Créer un programme python exo4_a.py qui à partir de la séquence nucléique TCTGTTAACCATCCACTTCG (chaîne de caractères) crée sa séquence complémentaire inverse, puis l'affiche.

• Créer un programme python exo4_b.py qui compte le nombre de chacune des bases (A, T, G, C) présente dans la séquence nucléique TCTGTTAACCATCCACTTCG, puis qui affiche ces nombres. Vous ferez une version qui utilise la fonction count() des listes et une autre version qui ne l'utilise pas.

• Créer un programme python exo4_c.py qui vérifie si la sous-séquence ATG (codon start) est présente dans la séquence nucléique TCTGTTATGACCATCCACTTCG, puis affiche "oui" ou "non" en fonction du résultat. Par la suite, modifier le programme pour qu'il affiche également la position de la sous-séquence "ATG" si elle est présente.

• Reprendre l'un des programmes exo4_a.py, exo4_b.py ou exo4_c.py et faire en sorte qu'il fonctionne pour plusieurs séquences (les séquences seront stockées dans une liste et chacune des séquences sera analysée)

  Exemple :

  seq1= "ATGCGTAGTCGT"
  seq2= "AGGTTCGTATG"
  mesSeq = [seq1,seq2]