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Module 1 d'administration de HPCCette formation est destinée à des administrateurs systèmes. Elle permet d'apprendre à configurer un cluster de calcul de manière simple selon trois axes majeurs: - l'installation et la configuration du noeud maitre - l'administration système et l'installation d'applications bioinformatiques - l'installation et la configuration de l'ordonnanceur Sun Grid Engine (SGE) |
Pré-requis
Savoir administrer des systèmes linux
Programme
- Installation système du noeud maître
- Launch job arrays with SGE
- Créer une image PXE pour l'installationde noeud de calcul
- Installer un noeud de calcul à l'aide du PXE
- Gestion des utilisateurs et des quotas
- Installation de Module environment
- Installation de logiciels et intégration de ces logiciels dans module environnment
- Installation de Sun Grid Engine
- Configuration des files d'attente
- Supervision des jobs d'analyse
Objectifs
Après ce cours, les participants seront capables de:- installer un cluster de calcul
- installer des logiciels de bioinformatique
- Configurer un ordonnanceur
- Gérer des files d'attentes de jobs
Support de cours
Instructors
- Ndomassi Tando (NT) - ndomassi.tando@ird.fr
- Bertrand Pitollat(BP) - bertrand.pitollat@cirad.fr
- Paul Kouadio - paul.kouadio@ird.fr
Formations
| Date | Lieu | Sujet | Participants | Formateurs | Liens | Unites |
| 2019 | Université Joseph KI-ZERBO (UJKZ) , Ouagadougou, Burkina faso | Administration de HPC Module1 | 12 | NT, PK | INERA, UJKZ, CERAAS | |
| 2018 | University of Ghana, Accra, Ghana | Administration de HPC Module1 | 3 | NT | UMR DIADE | |
| 2018 | CERAAS Thies, Sénegal | Administration de HPC Module1 | 6 | NT,BP | UMR DIADE,AGAP |