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Module 1 d'administration de HPC


Cette formation est destinée à des administrateurs systèmes. Elle permet d'apprendre à configurer un cluster de calcul de manière simple selon trois axes majeurs: - l'installation et la configuration du noeud maitre - l'administration système et l'installation d'applications bioinformatiques - l'installation et la configuration de l'ordonnanceur Sun Grid Engine (SGE)

Pré-requis

Savoir administrer des systèmes linux

Programme

  • Installation système du noeud maître
  • Launch job arrays with SGE
  • Créer une image PXE pour l'installationde noeud de calcul
  • Installer un noeud de calcul à l'aide du PXE
  • Gestion des utilisateurs et des quotas
  • Installation de Module environment
  • Installation de logiciels et intégration de ces logiciels dans module environnment
  • Installation de Sun Grid Engine
  • Configuration des files d'attente
  • Supervision des jobs d'analyse

Objectifs

Après ce cours, les participants seront capables de:
  • installer un cluster de calcul
  • installer des logiciels de bioinformatique
  • Configurer un ordonnanceur
  • Gérer des files d'attentes de jobs

Support de cours

Instructors

  • Ndomassi Tando (NT) - ndomassi.tando@ird.fr
  • Bertrand Pitollat(BP) - bertrand.pitollat@cirad.fr
  • Paul Kouadio - paul.kouadio@ird.fr

Formations

Date Lieu Sujet Participants Formateurs Liens Unites
2019 Université Joseph KI-ZERBO (UJKZ) , Ouagadougou, Burkina faso Administration de HPC Module1 12 NT, PK   INERA, UJKZ, CERAAS
2018 University of Ghana, Accra, Ghana Administration de HPC Module1 3 NT   UMR DIADE
2018 CERAAS Thies, Sénegal Administration de HPC Module1 6 NT,BP   UMR DIADE,AGAP